被子植物353探針是一種采用靶向捕獲探針對特定的基因組區(qū)域進行選擇性地富集,再進行測序的技術。被子植物探針的靶向捕獲測序技術,從600種被子植物中,篩選353個單拷貝核基因,作為捕獲序列,利用生物素化的RNA探針長度120 bp,對被子植物的353個單拷貝核基因進行定向捕獲測序。該技術的優(yōu)勢在于去除冗余數據的干擾,同時降低測序成本及基因組組裝的復雜性,進而提高NGS數據的利用率,促進被子植物的研究。
被子植物353探針是一種特殊的寡核苷酸探針,可以與植物基因組中大約80%以上的基因進行高度選擇性的雜交。這種探針的設計基于被子植物基因組中高度保守的序列區(qū)域,因此具有較高的特異性和敏感性,能夠在廣泛的植物物種中使用。
被子植物353探針還可用于以下方面:
揭示植物基因表達譜:使用被子植物探針可以對植物基因組進行全面的表達分析,揭示出植物不同發(fā)育階段和響應環(huán)境變化時的基因表達譜。通過對大量基因的表達水平進行定量測量,科學家們可以了解植物生長和發(fā)育過程中哪些基因起著重要作用,從而為植物育種和生產提供理論依據。
研究植物應對環(huán)境逆境的機制:植物在面對各種環(huán)境逆境(如干旱、鹽堿、低溫等)時,會觸發(fā)一系列的基因調控網絡以適應環(huán)境的變化。利用被子植物探針可以分析植物在逆境條件下的基因表達變化,進而揭示出植物應對逆境的分子機制和信號傳導途徑,為改良植物品種提供遺傳基礎。
探索植物進化歷程:被子植物探針不僅可以在現代植物中使用,還可以用于研究植物進化歷程中的關鍵基因。通過與不同植物物種進行比較分析,科學家們可以了解這些物種在基因組水平上的差異和變化,從而推測出植物進化的演化過程。